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Veeam wurde 2006 von Ratmir Timashev gegründet. Die ersten von Veeam auf den Markt gebrachten Produkte waren die Softwareanwendungen Veeam Monitor und Veeam Reporter zur Überwachung, Berichterstellung, Analyse und Dokumentation virtueller Infrastrukturen. Allgemeine Beachtung erlangte das Unternehmen 2007 mit FastSCP einem kostenlosen Produkt zur Erstellung von VM-Sicherungskopien, das Grundlage der Veeam-Datensicherungssoftware für die virtuelle Serverpartitionierung wurde.
2008 brachte das Unternehmen mit nur 10 Mitarbeitern die erste Version von Veeam Backup & Replication auf den Markt, die inkrementelle Datensicherungen, integriert in Datendeduplikation und Datenkompression, sowie Abbild-basierte Replikation ermöglichte.
Bis zum Jahr 2014 wuchs Veeam auf mehr als 1.200 Mitarbeiter mit dem Hauptsitz in Baar, Schweiz, sowie 17 weltweiten Niederlassungen und regionalen Firmenzentralen.